Course Details

Course Information
SemesterCourse Unit CodeCourse Unit TitleT+P+LCreditNumber of ECTS CreditsLast Updated Date
1BENG510ADVANCED BIOCHEMISTRY3+0+037,514.05.2025

 
Course Details
Language of Instruction English
Level of Course Unit Master's Degree
Department / Program BIOENGINEERING
Type of Program Formal Education
Type of Course Unit Elective
Course Delivery Method Face To Face
Objectives of the Course - To provide in depth understanding of the principles of selected topics from modern biochemistry necessary for further work in the biochemical areas.
- To expose the students to the current literature which is relevant to content of the class
Course Content This course reviews the chemistry of living systems emphasising on topics of biotechnological and biomedical interest. The course also surveys the methods used in modern biochemistry, so that students ae to able to understand the connection among empirical data, the established facts and concepts presented in the course. The first part of the course focus on the structure-function relation in proteins, nucleic acids, carbohydrates, lipids, and membranes. Important chemical concepts relevant to these molecules such as water, pH and weak chemical interactions is reviewed. This is followed by enzyme kinetics, pathways of intermediary metabolism, DNA replication, recombination, repair, transcription and protein synthesis.
Course Methods and Techniques Ders, Bologna süreci ilkelerine uygun olarak öğrenci merkezli ve bütüncül bir öğretim yaklaşımıyla yürütülecektir. Canlı sistemlerin kimyasal temellerine odaklanan bu ders kapsamında, biyoteknolojik ve biyomedikal açıdan önemli moleküler yapı ve işlev ilişkileri etkileşimli ders anlatımı yoluyla ele alınacaktır. Öğrencilerin yalnızca bilgiyi edinmesi değil, aynı zamanda deneysel veriler ile biyokimyasal kavramlar arasında bağ kurma becerisi kazanması hedeflenmektedir. Bu doğrultuda, ders içeriği proteinler, nükleik asitler, karbonhidratlar, lipidler ve biyolojik zarlar gibi temel biyomoleküllerin yapısal ve fonksiyonel özelliklerini kapsayacak şekilde yapılandırılmıştır. Ayrıca suyun özellikleri, pH, zayıf kimyasal etkileşimler gibi bu moleküllerle ilişkili temel kimyasal kavramlar da gözden geçirilecektir. Enzim kinetiği, ara metabolizma yolları, DNA replikasyonu, rekombinasyon, tamir mekanizmaları, transkripsiyon ve protein sentezi gibi ileri düzey konular ise derinlemesine teorik analizlerle işlenecektir. Öğrencilerin bilgiyi analiz etme, sentezleme ve yorumlama becerilerini geliştirmek amacıyla probleme dayalı öğrenme, vaka temelli tartışmalar ve grup içi iş birliğine dayalı proje çalışmaları uygulanacaktır. Derste işlenen konular, güncel bilimsel yayınlar ve dijital kaynaklar aracılığıyla desteklenecek; öğrencilerin bireysel öğrenme süreçlerini yönetmeleri teşvik edilecektir. Sürekli geri bildirim sağlayan tartışma oturumları ve öğrenci sunumları aracılığıyla bilimsel düşünme, sunum yapma ve eleştirel değerlendirme yetkinlikleri geliştirilecektir. Ayrıca, alana özgü yenilikleri tanıtmak amacıyla uzman konuk seminerlerine de yer verilecektir.
Prerequisites and co-requisities None
Course Coordinator Asist Prof.Dr. ALTAN ARCAN altan.ercan@agu.edu.tr
Name of Lecturers Asist Prof.Dr. EMEL BAŞAK GENCER AKÇOK
Assistants None
Work Placement(s) No

Recommended or Required Reading
Resources 1. Biochemistry: Concepts and Connections, Dean R. Appling, Spencer J. Anthony-Cahill, Christopher K. Mathews, Second Edition, Global edition, Pearson
Essentials of Biochemistry, Voet & Voet
Lehninger’s Principles of Biochemistry by David I. Nelson and Michael M. Cox, 7th Ed

Course Category
Science %100

Planned Learning Activities and Teaching Methods
Activities are given in detail in the section of "Assessment Methods and Criteria" and "Workload Calculation"

Assessment Methods and Criteria
Veri yok

 
ECTS Allocated Based on Student Workload
Activities Quantity Duration Total Work Load
Araştırma Ödevi 3 6 18
Ev Ödevi 5 4 20
Sunum için Hazırlık 5 6 30
Sunum 5 1 5
Okuma 14 1 14
Araştırma 14 2 28
Kişisel Çalışma 14 2 28
Yüz Yüze Ders 14 3 42
Final Sınavı 1 20 20
Total Work Load   Number of ECTS Credits 7,5 205

 
Course Learning Outcomes: Upon the successful completion of this course, students will be able to:
NoLearning Outcomes
1 Discriminate the principles of biochemistry in depth.
2 Identify the current literature relevant to the course content.
3 Discuss the chemical basis of the biological processes
4 Explain the structure-function relation in biological processes.

 
Weekly Detailed Course Contents
WeekTopicsStudy MaterialsMaterials
1 Biomolecules and their properties such as water, pH and weak chemical interaction
2 The structure-function relation in proteins, nucleic acids, carbohydrates, lipids, and membranes
4 The enzyme kinetics
5 The pathways of intermediary metabolism, DNA replication, recombination, repair, transcription and protein synthesis

 
Recommended Optional Programme Components
Veri yok
Contribution of Learning Outcomes to Programme Outcomes
P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12
C1 5 5 4 5 4 5 4 4 3 4 3 5
C2 5 5 4 5 4 5 4 4 3 4 3 5
C3 5 5 4 5 4 5 4 4 3 4 3 5
C4 5 5 4 5 4 5 4 4 3 4 3 5

  Contribution: 1: Very Slight 2:Slight 3:Moderate 4:Significant 5:Very Significant

  
  https://sis.agu.edu.tr/oibs/bologna/progCourseDetails.aspx?curCourse=77926&lang=en